transmission-daemon

• устанавливаем его, к примеру через apt-get
• /etc/init.d/transmission-daemon stop - останавливаем для редактирования настроек (про sudo писать не буду, добавляйте сами, где он нужен вам)
• nano /etc/transmission-daemon/settings.json
• настройки вроде легкочитаемые) введите сюда  логин/пароль (шифруется после сохранения), многое потом можно настроить через вэб-интерфейс
• у меня .torrent загружаются в /download, transmission-daemon сам подхватывает эти файлы и ставит на закачку
• usermod -aG username1 transmission-daemon - добавьте себя (username1) в группу transmision-daemon, чтоб не было проблем с правами на скачиваемые файлы
• /etc/init.d/transmission-daemon start - запускаем
• 127.0.0.1/transmission/web - по умолчанию

ps
можно еще написать скрипт уведомления на email об окончании скачивания..